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Wissenschaftliche Mitarbeiter PABI

Deutsche Ausschreibung siehe unten.

The Chair for Bioinformatics, Institute of Computer Science at the Friedrich-Schiller University Jena offers the following position:

PostDoc/PhD student as a research associate (Wissenschaftlicher Mitarbeiter)

The position is part of the project Parameterized Algorithmics for Bioinformatic, funded by the Deutsche Forschungsgemeinschaft. Scope of this project is to develop efficient algorithms for NP-hard bioinformatics problems, in particular using parameterized algorithmics. Focus of research is, besides developing such algorithms, also their implementation, evaluation, algorithm engineering, and biological case studies. Other methods for solving NP-hard optimization problems, such as Integer Linear Programming, will also be considered.

Requirements for PhD students: Applicants for this project must have or be about to obtain a Master’s degree or a qualification equivalent to the German Diploma in bioinformatics, computer science, or mathematics. The applicant should have an very good background in algorithmics. Introductory course level knowledge or better in biology and molecular biology is required. Good programming skills are required, and experience in software design would be helpful.

Requirements for Postdocs: Applicants for this project must have a PhD in bioinformatics, computer science, or mathematics. It is required that the applicant has research experience in developing paramterized algorithms, preferably for bioinformatics problems, documented by publications in scientific journals or conference proceedings.

Salary is according to Entgeltgruppe 13 TV-L, either a full position (for PostDocs) or 3/4 position (for PhD students). These positions are temporary appointments.

Handicapped applicants will be given preference in case of equal qualifications.

Please send your application with the usual documents (CV, list of publications, copies of certificates, preferred via email) until March 29th 2013 to:

E-Mail address:

Friedrich-Schiller-Universität Jena
Institut für Informatik
Lehrstuhl für Bioinformatik
Ernst-Abbe-Platz 2
07743 Jena, Germany


Am Lehrstuhl für Bioinformatik, Institut für Informatik der Friedrich-Schiller Universität Jena ist zum nächstmöglichen Zeitpunkt die Stelle eines

Wissenschaftlichen Mitarbeiters (Post-Doktorand oder Doktorand)

zu besetzen. Die Stelle ist Teil des von der DFG geförderten Projekts Parametrisierte Algorithmik bioinformatischer Probleme. Im Rahmen dieses Projektes sollen effiziente Algorithmen, insbesondere aus dem Bereich der parametrischen Algorithmik, für NP-schwere Probleme der Bioinformatik entwickelt werden. Fokus der Forschung sind, neben der Entwicklung solcher Algorithmen, auch ihre Implementierung, Evaluierung, Algorithm Engineering und biologische Fallstudien. Im Projekt sollen, wo dies möglich ist, auch andere informatische Methoden zu lösen NP-schwerer Optimierungsprobleme zum Einsatz kommen (beispielsweise Integer Linear Programming).

Anforderungen für Doktoranden. Bewerber müssen über ein abgeschlossenes Diplom- oder Master-Studium in den Bereichen Bioinformatik, Informatik oder Mathematik verfügen, oder ein solches Studium in naher Zukunft abschließen. Notwendig sind sehr gute Kenntnisse in Bereich Algorithmik sowie Grundkenntnisse in den Bereichen Biologie und Molekularbiologie. Die Projektarbeit erfordert gute Programmierkenntnisse, Erfahrung im Bereich Software Design ist wünschenswert.

Anforderungen für Post-Doktoranden. Bewerber müssen über eine abgeschlossene Promotion in den Bereichen Bioinformatik, Informatik oder Mathematik verfügen, oder ihre Dissertation bereits eingereicht haben. Für Post-Doktoranden zwingend erforderlich sind Vorarbeiten im Forschungsbereich parameterisierter Algorithmen, vorzugsweise für bioinformatische Probleme, nachgewiesen durch Publikationen in Fachzeitschriften oder Konferenz-Proceedings.

Die Vergütung erfolgt gemäß Entgeltgruppe 13 TV-L, es handelt sich um volle Stellen (für Post-Doktoranden) bzw. 3/4 Stellen (für Doktoranden). Die Möglichkeit zur wissenschaftlichen Qualifikation wird geboten. Die Stellen sind befristet.

Beiträge zur Lehre der Studiengänge Bioinformatik (Diplom, B.Sc., M.Sc.) werden in geringen Umfang erwartet.

Schwerbehinderte werden bei gleicher Eignung, Befähigung und fachlicher Qualifikation bevorzugt berücksichtigt.

Bewerbungen mit den üblichen Unterlagen (Lebenslauf, Publikationsliste, Zeugniskopien) sind vorzugsweise via EMail bis zum 29.03.2013  einzureichen bei:

E-Mail Adresse:

Friedrich-Schiller-Universität Jena
Institut für Informatik
Lehrstuhl für Bioinformatik
Ernst-Abbe-Platz 2
07743 Jena, Germany