Datamining und Sequenzanalyse

  • Veranstalter: Markus Fleischauer
  • Termine: Mo 10:15-11:45h ab 10.11.21 -> Mi 16:30-18:00h , Fr 12:30-14:00h
  • Wo: EAP2; LinuxPool 1

Vorläufiger Ablauf

Termin Thema Folien Aufgaben Daten Material
18.10.

• Organisatorisches
• Wiederholung Java/OOP
• Systemkonfiguration

 Einführung Leitfaden Projektpräsentation .gitignore  
. • git git      
 

• gradle
• Beginn Exakte Suche

gradle
exactSearch

 Aufgaben  ExactSearch datenExactSearch  
  Collection Collections      
  Unit Testing Unit Testing     Test Driven Development for beginners – Video
  Projektarbeit        
  Projektarbeit        
  Projektarbeit        
  Command Line Interfaces Command Line      
  Projektarbeit        
  Projektarbeit        
  • Abgabe Exakte Suche
• Vortrag Exakte Suche		        
03.12.21 • Beginn Alignments Folien Alignments Aufgaben Alignments datenAlignments  
  Projektarbeit        
  Projektarbeit        
  Projektarbeit        
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  Projektarbeit        
  Projektarbeit        
  • Abgabe Alignments
• Vortrag Alignments		        
  • Beginn Clustering   Aufgaben
Clustering		 datenClustering  
  Projektarbeit        
  Projektarbeit        
  Projektarbeit        
  Projektarbeit        
  Projektarbeit        
  Projektarbeit        
  Projektarbeit        
  • Abgabe Clustering
• Vortrag Clustering		        


Links und Literatur

Linux
Einen recht guten Einblick verschafft die Linux Fibel. Besonders am Anfang empfehlenswert sind die Kapitel: “Das Dateisystem”, “Die Bash” und “Nutzerkommandos”.
Java
Allgemeines über Java gibt es auf den offiziellen Seiten.
Java ist auch eine Insel beschreibt alle Aspekte der Sprache und ist komplett online verfügbar.
Ansonsten ist Stack Overflow euer Freund
Entwicklungs-Umgebungen
IntelliJ Idea hat bessere Profi-Funktionen und hervorragende itegration von gradle und git.
Eclipse als eine der großen und mächtigen Java IDEs (Open Source, Erweiterbar).
NetBeans ist Oracles offizielle Java IDE.
Algorithmen
The Algorithm Design Manual, Steven S. Skiena, Springer 1998 – Sehr gute Beispiele PDF-Version