Datamining und Sequenzanalyse

  • Veranstalter: Marvin Meusel, Markus Fleischauer
  • Termine: Mo 10:15-11:45h, Fr 12:15-13:45h, Linux-Pool I EAP

Vorläufiger Ablauf

 

Termin Thema Folien Aufgaben Daten Abgabetermin
19.10. • Organisatorisches
• Wiederholung Linux/Java/OOP
Einführung

Projekt-Praesentation

23.10. • git
• Gradle
git
Gradle
26.10. • Beginn Exakte Suche Folien-ExakteSuche  Aufgaben-ExakteSuche  Daten-ExakteSuche 11.12.2015
30.10. • Collections
• JavaDoc
 Collections
2.11. Projektarbeit
6.11. • Unit Testing  JUnit
9.11. • Commandline Interfaces CLI
13.11. Projektarbeit
16.11. Projektarbeit
20.11. Projektarbeit
23.11. Projektarbeit
27.11. Projektarbeit
30.11. Projektarbeit
4.12. • Beginn Alignments Alignments  Aufgaben-Alignments  Daten-Alignments  29.01.2016
7.12. Projektarbeit
11.12. • Abgabe Exakte Suche
• Vortrag Exakte Suche
14.12. Projektarbeit
18.12 Projektarbeit
4.1. Projektarbeit
8.1. Projektarbeit
11.1. Projektarbeit
15.1. Projektarbeit
18.1. Projektarbeit
22.1. • Beginn Clustering  Clustering  Aufgaben-Clustering  Daten-Clustering  04.03.2016
25.1. Projektarbeit
29.1. • Abgabe Alignments
• Vortrag Alignments
1.2. Projektarbeit
5.2. Projektarbeit
8.2. Projektarbeit
12.2. Projektarbeit

Die obigen Vortragstermine finden im SR 3423 statt.
Alle anderen Termine finden im Linux-Pool statt!

Links und Literatur

Linux
Einen recht guten Einblick verschafft die Linux Fibel. Besonders am Anfang empfehlenswert sind die Kapitel: “Das Dateisystem”, “Die Bash” und “Nutzerkommandos”.
Java
Allgemeines über Java gibt es auf den offiziellen Seiten.
Java API Dokumentation für Java 6 ist hier zu finden.
Java ist auch eine Insel beschreibt alle Aspekte der Sprache und ist komplett online verfügbar.
Das offizielle Java Forum ist auch ein guter Fundort für Problemlösungen.
Entwicklungs-Umgebungen
Eclipse als eine der großen und mächtigen Java IDEs.
IntelliJ Idea hat bessere Profi-Funktionen, verbraucht allerdings auch wesentlich mehr Ressourcen.
NetBeans ist Oracles offizielle Java IDE.
Algorithmen
The Algorithm Design Manual, Steven S. Skiena, Springer 1998 – Sehr gute Beispiele PDF-Version