Datamining und Sequenzanalyse

  • Veranstalter: Markus Fleischauer, Marcus Ludwig, Kai Dührkop
  • Termine: Mo 10:15-11:45h, Fr 12:15-13:45h, Linux-Pool I EAP2

Vorläufiger Ablauf

Termin Thema Folien Aufgaben Daten
17.10. • Organisatorisches
• Wiederholung Linux/Java/OOP
Einfuehrung Leitfaden-Projektpraesentation
21.10. • git
• Gradle
git und gradle
24.10. • Beginn Exakte Suche FolienExakteSuche AufgabenExakteSuche  Daten-ExakteSuche
28.10. • Collections
• JavaDoc
collections
JavaDoc
04.11. Projektarbeit
07.11. • Unit Testing  Testing
11.11. • Commandline Interfaces commandline
14.11. Projektarbeit
18.11. Projektarbeit
21.11. Projektarbeit
25.11. Projektarbeit
28.11. Projektarbeit
02.12. Projektarbeit
05.12. Projektarbeit
09.12. Projektarbeit
12.12. Beginn Alignments  VortragAlignments  AufgabenAlignments  Daten-Alignments
16.12. Projektarbeit
19.12. • Abgabe Exakte Suche
• Vortrag Exakte Suche
23.12. Projektarbeit
02.01. Projektarbeit
06.01. Projektarbeit
09.01. Projektarbeit
13.01. Projektarbeit
16.01. • Beginn Clustering  VortragClustering  AufgabenClustering  Daten-Clustering
20.1. Projektarbeit
23.01. • Abgabe Alignments
• Vortrag Alignments
27.01. Projektarbeit
30.01. Projektarbeit
03.02. Projektarbeit
Projektarbeit
 23.03 • Abgabe Clustering
• Vortrag Clustering

Die obigen Vortragstermine finden im SR 3423 statt.
Alle anderen Termine finden im Linux-Pool statt!

Links und Literatur

Linux
Einen recht guten Einblick verschafft die Linux Fibel. Besonders am Anfang empfehlenswert sind die Kapitel: “Das Dateisystem”, “Die Bash” und “Nutzerkommandos”.
Java
Allgemeines über Java gibt es auf den offiziellen Seiten.
Java API Dokumentation für Java 6 ist hier zu finden.
Java ist auch eine Insel beschreibt alle Aspekte der Sprache und ist komplett online verfügbar.
Das offizielle Java Forum ist auch ein guter Fundort für Problemlösungen.
Entwicklungs-Umgebungen
Eclipse als eine der großen und mächtigen Java IDEs.
IntelliJ Idea hat bessere Profi-Funktionen, verbraucht allerdings auch wesentlich mehr Ressourcen.
NetBeans ist Oracles offizielle Java IDE.
Algorithmen
The Algorithm Design Manual, Steven S. Skiena, Springer 1998 – Sehr gute Beispiele PDF-Version