- Veranstalter: Sebastian Böcker
- Vorlesung: Donnerstag, 12:30 Uhr – 14.00 Uhr;
SR 385SR 114 CZ3 - Übungsleiter: Kai Dührkop, Martin Hoffmann
- Übungstermin: Dienstag (beginnend: 23.10.2018); 12.15 Uhr – 13.45 Uhr; SR 114 AB4
- Tutorium: Montag, 12:30 – 14:00; 14 tägl. (Beginn: 29.10.2018);
SR 131 CZ3SR 3423, EAP2
Vorläufiger Ablauf
Termin | Themen | Folien | Übung |
18.10.2018 | Themenüberblick, Organisatorisches | Folien | |
25.10.2018 | Einführung Massenspektrometrie | Folien | uebung1 |
29.10.2018 | Tutorium | ||
01.11.2018 | Peptid De Novo Sequenzierung I | Folien | uebung2 |
08.11.2018 | Peptid De Novo Sequenzierung II | Beispiel | |
12.11.2018 | Tutorium | ||
15.11.2018 | Kombinatorik gewichteter Strings I | Folien | uebung3+4 |
22.11.2018 | Kombinatorik gewichteter Strings II | Folien | uebung5 |
26.11.2018 | Tutorium | ||
29.11.2018 | Datenbanksuche | Folien | uebung6 |
06.12.2018 | Signifikanz: p-values | Folien | uebung7 |
10.12.2018 | Tutorium | ||
13.12.2018 | Köderdatenbanken, FDR | Folien | uebung8 |
20.12.2018 | Isotopenmuster | Folien | uebung9 |
07.01.2019 | Tutorium | ||
10.01.2019 | Fragmentierungsbäume | Folien | |
17.01.2019 | Maximaler Farbenfroher Teilbaum Problem | Folien | |
21.01.2019 | Tutorium | ||
24.01.2019 | Suche in Metaboliten-Strukturdatenbanken | Folien | |
31.01.2019 | Retrospektive | ||
04.02.2019 | Tutorium: Klausurvorbereitung | ||
07.02.2019 | fällt aus |
Literatur
Ingvar Eidhammer, Kristian Flikka, Lennart Martens and Svein-Ole Mikalsen
Computational Methods for Mass Spectrometry Proteomics, Wiley Interscience, 2007.