- Veranstalter: Sebastian Böcker
- Vorlesung: Freitag (beginnend: 21.10.2016), 08:30 Uhr – 10.00 Uhr; SR 120 CZ3
- Übungsleiter: Kai Dührkop
- Übungstermin: Dienstag (beginnend: 01.11.2016); 12.15 Uhr – 13.45 Uhr; SR 125 CZ3
- Tutorium: Montag, 10:15 – 11:45; 14 tägl. (Beginn: 24.10.2016); SR 3423 EAP2
Vorläufige Ablauf
| Termin | Themen | Folien | Übung | Skript |
| 21.10.2016 | Themenüberblick, Organisatorisches | Folien | ||
| 28.10.2016 | Einführung Massenspektrometrie | Folien | Übung 1 | Einführung MS |
| 04.11.2016 | Peptid De Novo Sequenzierung I | Beispiel | Übung 2 | Peptid De Novo Seq. |
| 11.11.2016 | Peptid De Novo Sequenzierung II | Beispiel | Übung 3 | |
| 18.11.2016 | Kombinatorik gewichteter Strings | Folien | Übung 4 | Kombinatorik gewichteter Strings |
| 25.11.2016 | Kombinatorik gewichteter Strings II | Übung 5 | ||
| 02.12.2016 | Vergleichen von Spektren | Folien | Übung 6 | |
| 09.12.2016 | Vergleichen von Spektren | Folien | Spektralalignments | |
| 12.12.2016 – Tutorium | ||||
| 16.12.2016 | Decoy-Datenbanken | Folien | Übung 7 | Decoy-DB |
| 19.12.2016 – Vorlesung 10.15 – 11.45 Uhr; SR 3423 |
Isotopenmuster | Übung 8 | Isotopenverteilungen | |
| 06.01.2017 | Fragmentierungsbäume | Fragmentierungsbäume | ||
| 09.01.2017 – Tutorium | verlegt auf 30.01.17 | |||
| 13.01.2017 | FingerId, MetFrag, CFM-ID | |||
| 16.01.2017 – Tutorium | ||||
| 20.01.2017 | ||||
| 27.01.2017 | ||||
| 30.01.2017 – Tutorium | ||||
| 03.02.2017 |
Literatur
Ingvar Eidhammer, Kristian Flikka, Lennart Martens and Svein-Ole Mikalsen
Computational Methods for Mass Spectrometry Proteomics, Wiley Interscience, 2007.