Datamining und Sequenzanalyse

Howdy, Markus Fleischauer

  • Veranstalter: Markus Fleischauer
  • Termine: Mo 10:15-11:45h, Fr 12:30-14:00h
  • Wo: EAP2; LinuxPool 1

Vorläufiger Ablauf

Termin Thema Folien Aufgaben Daten
18.10.

• Organisatorisches
• Wiederholung Java/OOP
• Systemkonfiguration

Einführung Leitfaden Projektpraesentation .gitignore
. • git git    
 

• gradle
• Beginn Exakte Suche

gradle
exactSearch

Aufgaben  ExactSearch datenExactSearch
  Collection      
  Unit Testing      
  Projektarbeit      
  Projektarbeit      
  Projektarbeit      
  Commandline Interfaces      
  Projektarbeit      
  Projektarbeit      
  • Abgabe Exakte Suche
• Vortrag Exakte Suche
     
  • Beginn Alignments      
  Projektarbeit      
  Projektarbeit      
  Projektarbeit      
  Projektarbeit      
  Projektarbeit      
  Projektarbeit      
  Projektarbeit      
  Projektarbeit      
  • Abgabe Alignments
• Vortrag Alignments
     
  • Beginn Clustering      
  Projektarbeit      
  Projektarbeit      
  Projektarbeit      
  Projektarbeit      
  Projektarbeit      
  Projektarbeit      
  Projektarbeit      
  • Abgabe Clustering
• Vortrag Clustering
     


Links und Literatur

Linux
Einen recht guten Einblick verschafft die Linux Fibel. Besonders am Anfang empfehlenswert sind die Kapitel: “Das Dateisystem”, “Die Bash” und “Nutzerkommandos”.
Java
Allgemeines über Java gibt es auf den offiziellen Seiten.
Java ist auch eine Insel beschreibt alle Aspekte der Sprache und ist komplett online verfügbar.
Ansonsten ist Stack Overflow euer Freund
Entwicklungs-Umgebungen
IntelliJ Idea hat bessere Profi-Funktionen und hervorragende itegration von gradle und git.
Eclipse als eine der großen und mächtigen Java IDEs (Open Source, Erweiterbar).
NetBeans ist Oracles offizielle Java IDE.
Algorithmen
The Algorithm Design Manual, Steven S. Skiena, Springer 1998 – Sehr gute Beispiele PDF-Version