Algorithmische Massenspektrometrie

  • Veranstalter: Sebastian Böcker
  • Vorlesung: Montag, 12:15 -13:45h; SR 123 CZ3
  • Übungsleiter: Martin Hoffmann
  • Übungstermin: Dienstag, 12:15 -13:45h; SR 123 CZ3
  • Tutorium: Donnerstag, 12:15 -13:45h; R3423 im EAP2 (14 tägl.)

Vorläufiger Ablauf

Termin Themen Folien Übung
17.10.2022 Einführung Massenspektrometrie Folien  
27.10.2022 Analyse von Biomolekülen Folien uebung1
03.11.2022 Tutorium    
07.11.2022 Peptid De Novo Sequenzierung I Folien uebung2
14.11.2022 Peptid De Novo Sequenzierung II Folien Übung 3
21.11.2022 Kombinatorik gewichteter Strings I Folien Übung 4
24.11.2022 Tutorium (findet im SR 3423, EAP2 statt)    
28.11.2022 Kombinatorik gewichteter Strings II Folien Übung 5
05.12.2022 Datenbanksuche Folien Übung 6
08.12.2022 Tutorium    
12.12.2022 Signifikanz: p-values Folien

Übung 7 (table_1)

  Weihnachtsferien    
05.01.2023 Köderdatenbanken, FDR Folien Übung 8
09.01.2023 Isotopenmuster Folien Übung 9
16.01.2023 Fragmentierungsbäume Folien uebung10
19.01.2023 Tutorium    
30.01.2023 Maximaler Farbenfroher Teilbaum Problem Folien Übung 11
02.02.2023 Tutorium    
06.02.2023 Suche in Metaboliten-Strukturdatenbanken Folien  
09.02.2023 Retrospektive    
10.02.2023 Tutorium    

Literatur

Lehrbuch Algorithmische Massenspektrometrie von Sebastian Böcker (online)

Jupyter Notebook zu den Übungsserien