Algorithmische Massenspektrometrie

  • Veranstalter: Sebastian Böcker
  • Vorlesung: Montag, 12:30h – 14:00h; SR 123 CZ3
  • Übungsleiter: Martin Hoffmann
  • Übungstermin: Dienstag, 12:30h – 14:00h; SR 123 CZ3
  • Tutorium: Donnerstag, 12:30h – 14:00h; SR 123 C3 (14 tägl.)

Vorläufiger Ablauf

Termin Themen Folien Übung
  Einführung Massenspektrometrie Folien  
27.10.2022 Analyse von Biomolekülen Folien uebung1
07.11.2022 Peptid De Novo Sequenzierung I Folien uebung2
14.11.2022 Peptid De Novo Sequenzierung II Folien Übung 3
21.11.2022 Kombinatorik gewichteter Strings I Folien Übung 4
28.11.2022 Kombinatorik gewichteter Strings II Folien Übung 5
05.12.2022 Datenbanksuche Folien Übung 6
28.11.2022 Signifikanz: p-values Folien

Übung 7
(table_1)

05.12.2022 Köderdatenbanken, FDR Folien Übung 8
12.12.2022 Isotopenmuster Folien Übung 9
  Weihnachtsferien    
09.01.2023 Fragmentierungsbäume Folien uebung10
16.01.2023 Maximaler Farbenfroher Teilbaum Problem Folien Übung 11
23.01.2023 Suche in Metaboliten-Strukturdatenbanken Folien  
30.01.2023 Retrospektive    

Literatur

Lehrbuch Algorithmische Massenspektrometrie von Sebastian Böcker (online)

Jupyter Notebook zu den Übungsserien