Bioinformatische Methoden in der Genomforschung

  • Veranstalter: Sebastian Böcker
  • Vorlesungstermin: Do 12.30-14.00h, SR 122 CZ3
  • Tutorium: Beginn: 01.11.17, Mi 10.15-11.45h, SR 3423 EAP2, 14-tägl.
  • Übungstermin: Mo 12.30-14.00h, SR 131 CZ3
  • Übungsleiter: Martin Hoffmann

  • Vorläufiger Ablaufplan

    Termin Themen Folien Übungsausgabe Übungsabgabe
    19.10. Vorlesung: Einführung
    23.10. Übung entfällt
    26.10. Vorlesung: BACs sortieren Vorlesung1_Folien uebung1  02.11.2017
    30.10. Übung
    01.11. Tutorium
    02.11. Vorlesung: Microarrays 1 Vorlesung2_folien uebung2  09.11.2017
    06.11. Übung
    09.11. Vorlesung: Microarrays 2 Vorlesung3_Folien uebung3  23.11.2017
    13.11. Übung
    15.11. Tutorium
    16.11. Vorlesung: Datenanalyse + Hierarchisches Clustern v4
    20.11. Übung
    23.11. Vorlesung: k-means, Cluster Editing, TransClust v5 uebung4
    27.11. Übung
    29.11. Tutorium
    30.11. Vorlesung: Synthenie, vergleichende Genomik v6 uebung5
    04.12. Übung
    07.12. Vorlesung: Sorting by Inversions 1 v10 uebung6
    11.12. Übung
    13.12. Tutorium
    14.12. Vorlesung: Sorting by Inversions 2 v8_components uebung7
    18.12. Übung
    21.12. Vorlesung: Connecting Intervals v12 uebung8
    10.01. Tutorium
    11.01. Gencluster II v13 uebung9
    15.01. Übung
    18.01. Vorlesung: Motif Finding Problem Folien Übung 10
    22.01. Übung
    24.01. Tutorium
    25.01. Vorlesung: Gibbs-Sampler Folien Übung 11
    29.01. Übung
    31.01. Tutorium
    01.02. Vorlesung: Expectation Maximization  Folien
    05.02. Übung

    Weitere Themen werden im Lauf des Semesters in der Tabelle hinzugefügt.

    Literatur

    • zu Physical Mapping: Skript Algorithmen der Bioinformatik von Volker Sperschneider, Kapitel 1 sowie Skript Algorithmische Bioinformatik I/II von Volker Heun, Kapitel 6