Algorithmische Massenspektrometrie

  • Veranstalter: Sebastian Böcker
  • Vorlesung: Onlineveranstaltung, Videodateien zum Download
  • Übungsleiter: Kai Dührkop, Martin Hoffmann
  • Übungstermin: Onlineveranstaltung, Donnerstag, 12:15 – 13:45 Uhr
  • Tutorium: Onlineveranstaltung, ZOOM-Meeting, Montag, 12:15 Uhr – 13:45 Uhr

Vorläufiger Ablauf

Termin Themen Folien Übung
02.11.2020 Einführung Massenspektrometrie Folien  
02.11.2020 Analyse von Biomolekülen Folien uebung1
09.11.2020 Peptid De Novo Sequenzierung I Folien uebung2
16.11.2020 Peptid De Novo Sequenzierung II Beispiel  
23.11.2020 Kombinatorik gewichteter Strings I Folien uebung3+4
30.11.2020 Kombinatorik gewichteter Strings II Folien uebung5
07.12.2020 Datenbanksuche Folien uebung6
14.12.2020 Signifikanz: p-values Folien uebung7
  Weihnachtsferien    
04.01.2021 Köderdatenbanken, FDR Folien uebung8
11.01.2021 Isotopenmuster Folien uebung9
18.01.2021 Fragmentierungsbäume Folien  
25.01.2021 Maximaler Farbenfroher Teilbaum Problem Folien  
01.02.2021 Suche in Metaboliten-Strukturdatenbanken Folien  
08.02.2021 Retrospektive    

Literatur

Ingvar Eidhammer, Kristian Flikka, Lennart Martens and Svein-Ole Mikalsen
Computational Methods for Mass Spectrometry Proteomics, Wiley Interscience, 2007.