Algorithmische Massenspektrometrie | Lehrstuhl Bioinformatik Jena

Veranstalter: Sebastian Böcker
Vorlesung: Onlineveranstaltung, Videodateien zum Download
Übungsleiter: Kai Dührkop, Martin Hoffmann
Übungstermin: Onlineveranstaltung, Donnerstag, 12:15 – 13:45 Uhr
Tutorium: Onlineveranstaltung, ZOOM-Meeting, Montag, 12:15 Uhr – 13:45 Uhr

Vorläufiger Ablauf

Termin	Themen	Folien	Übung
02.11.2020	Einführung Massenspektrometrie	Folien
02.11.2020	Analyse von Biomolekülen	Folien	uebung1
09.11.2020	Peptid De Novo Sequenzierung I	Folien	uebung2
16.11.2020	Peptid De Novo Sequenzierung II	Folien	Übung 3
23.11.2020	Kombinatorik gewichteter Strings I	Folien	Übung 4
30.11.2020	Kombinatorik gewichteter Strings II	Folien	Übung 5
07.12.2020	Datenbanksuche	Folien	Übung 6
14.12.2020	Signifikanz: p-values	Folien	Übung 7 (table_1)
	Weihnachtsferien
04.01.2021	Köderdatenbanken, FDR	Folien	Übung 8
11.01.2021	Isotopenmuster	Folien	Übung 9
18.01.2021	Fragmentierungsbäume	Folien	uebung10
25.01.2021	Maximaler Farbenfroher Teilbaum Problem	Folien
01.02.2021	Suche in Metaboliten-Strukturdatenbanken	Folien
08.02.2021	Retrospektive

Literatur

Lehrbuch Algorithmische Massenspektrometrie von Sebastian Böcker (online)

Bioinfowelten News

Wissen gegen die Angst: Ein Blick in den genetischen Inhalt des SARS-CoV-2 mRNA Impfstoffes 04/01/2021

„Lässt du dich gegen SARS-CoV-2 impfen?“ Diese Frage wurde mir in den letzten Wochen mehrfach gestellt und meine Antwort lautet: ja. Sobald alle gefährdeten Gruppen geimpft sind, werde ich mich impfen lassen. Ich möchte... The post Wissen gegen die Angst: Ein Blick in den genetischen Inhalt des SARS-CoV-2 mRNA Impfstoffes first appeared on BioinfoWelten.

Franziska Hufsky

Eine Hommage an mein liebstes Heißgetränk 24/10/2019

Zu Hause, im Büro, unterwegs, früh, mittags, abends, Espresso, Cappuccino oder Americano — Kaffee könnte ich eigentlich immer und überall trinken. Und mit dieser Liebe zum Kaffee stehe ich gewiss nicht alleine da. Kaffee ist... The post Eine Hommage an mein liebstes Heißgetränk first appeared on BioinfoWelten.

Franziska Hufsky

Wie die Metagenomik Einzug in Krankenhäuser hält 24/09/2019

In einem meiner letzten Beiträge habe ich euch bereits erzählt, wie verschiedene Fortschritte in der Mikrobiologie einen völlig neuen Einblick in die Welt der Viren ermöglichen. Metagenomik und hochmoderne Sequenziertechnologien werden in vielen Forschungsbereichen... The post Wie die Metagenomik Einzug in Krankenhäuser hält first appeared on BioinfoWelten.

Franziska Hufsky

Turing-Mechanismen: Wie das Zebra zu seinen Streifen kommt 16/09/2019

Alan Turing gehört zweifelsohne zu den interessantesten Persönlichkeiten der Geschichte der Informatik. Er entwickelte das Konzept der Turing-Maschine, ein abstraktes Modell eines Computers, mit dem man testen kann, ob ein Problem überhaupt berechenbar (also... The post Turing-Mechanismen: Wie das Zebra zu seinen Streifen kommt first appeared on BioinfoWelten.

Franziska Hufsky

Wie das Klima die Gene beeinflusst 05/08/2019

Es ist Sommer. Es ist heiß. Sehr heiß. Es regnet kaum. Gestern war ich wandern. Und da fiel mir ein mal mehr die ausgetrocknete Natur auf. Der Klimawandel ist real. Ich möchte mich jetzt... The post Wie das Klima die Gene beeinflusst first appeared on BioinfoWelten.

Franziska Hufsky

Fledermäuse: Einzigartig und gefürchtet 19/07/2019

Falls ihr es noch nicht wusstet: Fledermäuse sind ziemlich coole Tiere! Ich bin großer Fledermausfan. Ich hatte auch schon immer etwas für Vampirgeschichten übrig. Aber woher kommt diese Faszination für die als „Blutsauger“ bekannten... The post Fledermäuse: Einzigartig und gefürchtet first appeared on BioinfoWelten.

Franziska Hufsky

Virale Mitbewohner im Darm: Mehr als Durchfall und Erbrechen 05/07/2019

Die menschliche Darmflora ist ein eigenes Ökosystem. Ein einziges Gramm Darminhalt beherbergt mehr Lebewesen als die Erde Menschen. Die Darmflora hat das Image der Bakterien gerettet. Dabei handelt es sich um mehr als einen... The post Virale Mitbewohner im Darm: Mehr als Durchfall und Erbrechen first appeared on BioinfoWelten.

Franziska Hufsky

Apokalypse-Virus: Hollywood oder Realität? 26/06/2019

Ich gehe davon aus, dass jeder von euch mindestens einen der Viren-Zombieklassiker, zum Beispiel „28 Days Later“ oder „I Am Legend“, gesehen hat. Und egal wie Hollywood-like die Umsetzung dieser Filme sein mag, das... The post Apokalypse-Virus: Hollywood oder Realität? first appeared on BioinfoWelten.

Franziska Hufsky

Die Geschichte der Erforschung des chemischen Universums 18/06/2019

Heute bin ich auf eine interessante Veröffentlichung über die Geschichte der Chemie gestoßen, genauer gesagt, über die Entdeckung neuer chemischer Strukturen. Spannend finde ich das, weil Strukturdatenbanken die grundlegende Ressource meines Doktorarbeitsthemas waren, und... The post Die Geschichte der Erforschung des chemischen Universums first appeared on BioinfoWelten.

Franziska Hufsky

Auf der Suche nach einem Wirkstoff gegen das Hepatitis-E-Virus 14/06/2019

Liebe Freunde der Bioinformatik, lange Zeit habe ich nichts von mir hören lassen. Das Problem: Zeitmangel! Wobei die mangelnde Zeit weniger das Schreiben an sich betrifft. Das fällt mir leicht und geht recht schnell.... The post Auf der Suche nach einem Wirkstoff gegen das Hepatitis-E-Virus first appeared on BioinfoWelten.

Franziska Hufsky