Algorithmische Massenspektrometrie

  • Veranstalter: Sebastian Böcker
  • Letztmalig/aktuell im WiSe 2024/25
  • Nächste Instanz geplant im WiSe 2026/27
  • Vorlesung: Montag, 12:30 -14:00h; SR 130 CZ3
  • Übungsleiter: Fleming Kretschmer
  • Übungstermin: Dienstag, 12:30 -14:00; SR 123 CZ3
  • Tutorium: Montag, 14:15 -15:45h; R3423 im EAP2 (14 tägl.)
    (21.10.24 / 11.11.24 / 18.11.24 / 02.12.24 / 16.12.24 / 13.01.25 / 27.01.25)

Vorläufiger Ablauf

TerminThemenFolienÜbung
14.10.2024Einführung MassenspektrometrieFolien 
21.10.2024Analyse von BiomolekülenFolienuebung1
28.10.2024Peptid De Novo Sequenzierung IFolienuebung2
04.11.2024Peptid De Novo Sequenzierung IIFolienÜbung 3
11.11.2024Kombinatorik gewichteter Strings IFolienÜbung 4
18.11.2024Kombinatorik gewichteter Strings IIFolienÜbung 5
25.11.2024DatenbanksucheFolienÜbung 6
02.12.2024Signifikanz: p-valuesFolienÜbung 7
(table_1)
09.12.2024Köderdatenbanken, FDRFolienÜbung 8
16.12.2024verschoben auf 06.01.25
Weihnachtsferien
06.01.2025IsotopenmusterFolienÜbung 9
13.01.2025FragmentierungsbäumeFolienuebung10
20.01.2025Maximaler Farbenfroher Teilbaum ProblemFolienÜbung 11
27.01.2025Suche in Metaboliten-StrukturdatenbankenFolien 
03.02.2025Retrospektive / Tutorium

Literatur

Lehrbuch Algorithmische Massenspektrometrie von Sebastian Böcker (online)

Jupyter Notebook zu den Übungsserien