Algorithmische Massenspektrometrie

  • Veranstalter: Sebastian Böcker
  • Letztmalig/aktuell im WiSe 2022/23
  • Nächste Instanz geplant im WiSe 2024/25
  • Vorlesung: Montag, 12:15 -13:45h; SR 123 CZ3
  • Übungsleiter: Martin Hoffmann
  • Übungstermin: Dienstag, 12:15 -13:45h; SR 123 CZ3
  • Tutorium: Donnerstag, 12:15 -13:45h; R3423 im EAP2 (14 tägl.)

Vorläufiger Ablauf

TerminThemenFolienÜbung
17.10.2022Einführung MassenspektrometrieFolien 
27.10.2022Analyse von BiomolekülenFolienuebung1
03.11.2022Tutorium  
07.11.2022Peptid De Novo Sequenzierung IFolienuebung2
14.11.2022Peptid De Novo Sequenzierung IIFolienÜbung 3
21.11.2022Kombinatorik gewichteter Strings IFolienÜbung 4
24.11.2022Tutorium (findet im SR 3423, EAP2 statt)  
28.11.2022Kombinatorik gewichteter Strings IIFolienÜbung 5
05.12.2022DatenbanksucheFolienÜbung 6
08.12.2022Tutorium  
12.12.2022Signifikanz: p-valuesFolien

Übung 7 (table_1)

 Weihnachtsferien  
05.01.2023Köderdatenbanken, FDRFolienÜbung 8
09.01.2023IsotopenmusterFolienÜbung 9
16.01.2023FragmentierungsbäumeFolienuebung10
19.01.2023Tutorium  
30.01.2023Maximaler Farbenfroher Teilbaum ProblemFolienÜbung 11
02.02.2023Tutorium  
06.02.2023Suche in Metaboliten-StrukturdatenbankenFolien 
09.02.2023Retrospektive / Tutorium  
    

Literatur

Lehrbuch Algorithmische Massenspektrometrie von Sebastian Böcker (online)

Jupyter Notebook zu den Übungsserien