Scriptsprachen | Lehrstuhl Bioinformatik Jena

Seminarleiter: Konstantin Riege, Sascha Winter, Kai Dührkop
Termin: 4.8.-15.8., 2 Wochen im Block
Start um 10 Uhr im Linux Pool, EAP

Vorläufiger Ablaufplan

Termin	Themen	Folien	Übung	Daten
11.08	Python Einführung	Basics, Collections, Utils, IO	Aufgaben, Aufgabe1	Daten
12.08	Funktionale Programmierung	ErrorsStandardLibsClasses, Functional	functional.py, massbank
13.08	Biopython	Biopython, ipython	ÜbungBiopython	Umaydis.tar Umaydis.gb
14.08	CSV, JSON, XML and Web Services	Data Formats, Web Services	webserv	pubchem.xml
15.08	SciPy	SciPy	massbank

Bioinfowelten News

Wissen gegen die Angst: Ein Blick in den genetischen Inhalt des SARS-CoV-2 mRNA Impfstoffes 04/01/2021

„Lässt du dich gegen SARS-CoV-2 impfen?“ Diese Frage wurde mir in den letzten Wochen mehrfach gestellt und meine Antwort lautet: ja. Sobald alle gefährdeten Gruppen geimpft sind, werde ich mich impfen lassen. Ich möchte... The post Wissen gegen die Angst: Ein Blick in den genetischen Inhalt des SARS-CoV-2 mRNA Impfstoffes first appeared on BioinfoWelten.

Franziska Hufsky

Eine Hommage an mein liebstes Heißgetränk 24/10/2019

Zu Hause, im Büro, unterwegs, früh, mittags, abends, Espresso, Cappuccino oder Americano — Kaffee könnte ich eigentlich immer und überall trinken. Und mit dieser Liebe zum Kaffee stehe ich gewiss nicht alleine da. Kaffee ist... The post Eine Hommage an mein liebstes Heißgetränk first appeared on BioinfoWelten.

Franziska Hufsky

Wie die Metagenomik Einzug in Krankenhäuser hält 24/09/2019

In einem meiner letzten Beiträge habe ich euch bereits erzählt, wie verschiedene Fortschritte in der Mikrobiologie einen völlig neuen Einblick in die Welt der Viren ermöglichen. Metagenomik und hochmoderne Sequenziertechnologien werden in vielen Forschungsbereichen... The post Wie die Metagenomik Einzug in Krankenhäuser hält first appeared on BioinfoWelten.

Franziska Hufsky

Turing-Mechanismen: Wie das Zebra zu seinen Streifen kommt 16/09/2019

Alan Turing gehört zweifelsohne zu den interessantesten Persönlichkeiten der Geschichte der Informatik. Er entwickelte das Konzept der Turing-Maschine, ein abstraktes Modell eines Computers, mit dem man testen kann, ob ein Problem überhaupt berechenbar (also... The post Turing-Mechanismen: Wie das Zebra zu seinen Streifen kommt first appeared on BioinfoWelten.

Franziska Hufsky

Wie das Klima die Gene beeinflusst 05/08/2019

Es ist Sommer. Es ist heiß. Sehr heiß. Es regnet kaum. Gestern war ich wandern. Und da fiel mir ein mal mehr die ausgetrocknete Natur auf. Der Klimawandel ist real. Ich möchte mich jetzt... The post Wie das Klima die Gene beeinflusst first appeared on BioinfoWelten.

Franziska Hufsky

Fledermäuse: Einzigartig und gefürchtet 19/07/2019

Falls ihr es noch nicht wusstet: Fledermäuse sind ziemlich coole Tiere! Ich bin großer Fledermausfan. Ich hatte auch schon immer etwas für Vampirgeschichten übrig. Aber woher kommt diese Faszination für die als „Blutsauger“ bekannten... The post Fledermäuse: Einzigartig und gefürchtet first appeared on BioinfoWelten.

Franziska Hufsky

Virale Mitbewohner im Darm: Mehr als Durchfall und Erbrechen 05/07/2019

Die menschliche Darmflora ist ein eigenes Ökosystem. Ein einziges Gramm Darminhalt beherbergt mehr Lebewesen als die Erde Menschen. Die Darmflora hat das Image der Bakterien gerettet. Dabei handelt es sich um mehr als einen... The post Virale Mitbewohner im Darm: Mehr als Durchfall und Erbrechen first appeared on BioinfoWelten.

Franziska Hufsky

Apokalypse-Virus: Hollywood oder Realität? 26/06/2019

Ich gehe davon aus, dass jeder von euch mindestens einen der Viren-Zombieklassiker, zum Beispiel „28 Days Later“ oder „I Am Legend“, gesehen hat. Und egal wie Hollywood-like die Umsetzung dieser Filme sein mag, das... The post Apokalypse-Virus: Hollywood oder Realität? first appeared on BioinfoWelten.

Franziska Hufsky

Die Geschichte der Erforschung des chemischen Universums 18/06/2019

Heute bin ich auf eine interessante Veröffentlichung über die Geschichte der Chemie gestoßen, genauer gesagt, über die Entdeckung neuer chemischer Strukturen. Spannend finde ich das, weil Strukturdatenbanken die grundlegende Ressource meines Doktorarbeitsthemas waren, und... The post Die Geschichte der Erforschung des chemischen Universums first appeared on BioinfoWelten.

Franziska Hufsky

Auf der Suche nach einem Wirkstoff gegen das Hepatitis-E-Virus 14/06/2019

Liebe Freunde der Bioinformatik, lange Zeit habe ich nichts von mir hören lassen. Das Problem: Zeitmangel! Wobei die mangelnde Zeit weniger das Schreiben an sich betrifft. Das fällt mir leicht und geht recht schnell.... The post Auf der Suche nach einem Wirkstoff gegen das Hepatitis-E-Virus first appeared on BioinfoWelten.

Franziska Hufsky