Algorithmische Massenspektrometrie

  • Veranstalter: Sebastian Böcker
  • Vorlesung: Donnerstag, 12:30 Uhr – 14.00 Uhr; SR 385 CZ3
  • Übungsleiter: Kai Dührkop, Martin Hoffmann
  • Übungstermin: Dienstag (beginnend: 23.10.2018); 12.15 Uhr – 13.45 Uhr; SR 114 AB4
  • Tutorium: Montag, 12:30 – 14:00; 14 tägl. (Beginn: 29.10.2018); SR 131 CZ3

Vorläufiger Ablauf

Termin Themen Folien Übung Skript
18.10.2018 Themenüberblick, Organisatorisches Folien
25.10.2018 Einführung Massenspektrometrie Folien
29.10.2018 – Tutorium
01.11.2018 Peptid De Novo Sequenzierung I Beispiel
08.11.2018 Peptid De Novo Sequenzierung II Beispiel
12.11.2018 – Tutorium
15.11.2018 Kombinatorik gewichteter Strings Folien
22.11.2018 Kombinatorik gewichteter Strings II
26.11.2018 – Tutorium
29.11.2018 Vergleichen von Spektren Folien
06.12.2018 Vergleichen von Spektren Folien
10.12.2018 – Tutorium
13.12.2018 Decoy-Datenbanken Folien
20.12.2018 Isotopenmuster
07.01.2019 – Tutorium
10.01.2019 Fragmentierungsbäume
17.01.2019 FingerId, MetFrag, CFM-ID
21.01.2019 – Tutorium
24.01.2019
31.01.2019
04.02.2019 – Tutorium
07.02.2019

Literatur

Ingvar Eidhammer, Kristian Flikka, Lennart Martens and Svein-Ole Mikalsen
Computational Methods for Mass Spectrometry Proteomics, Wiley Interscience, 2007.